Можно ли отправить счёт на оплату в Диадоке в формализованном XML?

Да. Старый ответ на Yasnoo устарел: Диадок поддерживает формализованный счёт на оплату.

В актуальной документации API Диадока для счёта на оплату используется тип XmlProformaInvoice. XML можно генерировать, подписывать, отправлять и разбирать средствами API. Конкретные возможности модуля для 1С зависят от его версии и настроек интеграции.